Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StambpQ9CQ26 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms