Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnaseh2cQ9CQ18 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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