Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms