Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms