Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms