Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms