Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt23Q99PS0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt23Q99PS0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms