Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn6Q99PL6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms