Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms