Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf3Q99P51 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rassf3Q99P51 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf3Q99P51 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms