Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem2Q99NH8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms