Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rims1Q99NE5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms