Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms