Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rassf1Q99MK9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms