Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprtQ99M80 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PtprtQ99M80 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms