Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms