Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms