Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms