Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms