Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms