Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms