Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms