Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms