Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TrabdQ99JY4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TrabdQ99JY4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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TrabdQ99JY4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TrabdQ99JY4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TrabdQ99JY4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TrabdQ99JY4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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TrabdQ99JY4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TrabdQ99JY4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrabdQ99JY4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TrabdQ99JY4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TrabdQ99JY4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrabdQ99JY4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrabdQ99JY4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrabdQ99JY4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrabdQ99JY4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms