Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms