Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfxn1Q99JR1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms