Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms