Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CsprsQ99388 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms