Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim7Q923T7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms