Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim59Q922Y2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms