Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms