Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca5Q91ZW3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms