Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm2Q91YD4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpm2Q91YD4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm2Q91YD4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms