Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms