Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms