Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApofQ91V80 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApofQ91V80 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms