Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc2Q8VI47 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc2Q8VI47 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc2Q8VI47 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms