Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms