Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenomQ8VHC3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms