Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhdc3Q8VEM9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms