Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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