Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms