Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn4Q8VCH8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms