Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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