Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med17Q8VCD5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms