Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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