Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkl1Q8K4J6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkl1Q8K4J6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms