Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
OptnQ8K3K8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms