Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sash3Q8K352 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sash3Q8K352 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms