Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsl1Q8K305 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsl1Q8K305 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsl1Q8K305 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsl1Q8K305 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsl1Q8K305 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsl1Q8K305 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsl1Q8K305 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsl1Q8K305 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsl1Q8K305 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms